Fatih, Fevzi Paşa Caddesi ile Macar Kardeşler Caddesi’nin kesişme noktasındadır. Medrese 1701 yılında Şeyhulislam Erzurumlu Seyyid Mustafa Efendi tarafından yaptırılmıştır. Solda fevkânî mescid ve dershane mevcuttur. On iki pencere ile aydınlanan Mescid’i medresenin içinde bulunmaktadır. Mihrabı vardır.
Cumhuriyetten sonra Ali Emiri Efendi’nin kitaplarını bağışlamasıyla halka açık bir kütüphane haline getirilmiştir.